教育

海南大学

药学 - 本科

2018 - 2022

贾爱群课题组,导师李军舰副教授

大连医科大学

生物化学与分子生物学 - 硕士研究生

2022 - 2025

杨庆凯课题组,导师宋成丽副教授

语言

Language

英语

CET-6 431分

项目经验

神经胶质瘤相关蛋白数据库建立及靶向小分子的虚拟筛选

本人毕业课题

对cbioportal网站内的10个神经胶质瘤相关项目做神经胶质瘤相关的突变基因进行统计,鉴别出相关性最高的突变蛋白IDH1

Vina-GPU软件对IDH1 R132H蛋白进行虚拟筛选,虚拟筛选的配体库为ZINC20 lead-like化合物数据库

Swiss-ADME网站预测配体血脑屏障透过性,筛选出可以透过血脑屏障的配体化合物

PLIP网站对蛋白-配体相互作用进行分析

gromacs软件对蛋白-配体复合物进行分子动力学模拟

alphafold v2.3.2对其他神经胶质瘤相关蛋白进行结构预测,建立神经胶质瘤相关蛋白结构数据库

目前已完成所有工作,正在整理相关结果撰写文章

KRAS

使用ZINC20 lead-like数据库对KRAS蛋白进行虚拟筛选,寻找靶向KRAS突变体的苗头化合物

cGAS

靶向cGAS的结合口袋使用中药数据库TCMbank做虚拟筛选,寻找具有抑制cGAS酶活性的靶向苗头化合物

技能

  • 虚拟筛选、蛋白质结构相关软件

    虚拟筛选软件:Vina-GPU

    分子动力学模拟软件:GROMACS

    蛋白质结构预测软件:AlphaFold 2

    蛋白质可视化软件:PyMOL、ChimeraX

    作图软件:PS、AI

    熟练使用桌面版/服务器版Ubuntu系统

课程和证书

获奖情况

2022

大连医科大学研究生入学奖学金